一、短期投资的初始计量
小企业会计准则下，设置“短期投资”科目计量企业取得的短期投资，取得投资时，应该采用历史成本计量，交易费用计入投资成本；而企业会计准则中，设置“交易性金融资产——成本”科目核算企业取得的短期投资，企业会计准则规定，取得资产须按照公允价值进行计量，相关交易费用在发生时直接计入投资收益。
二、短期投资的后续计量
小企业会计准则下，设置“应收股利”“应收利息”科目，核算小企业持有短期投资期间获得的收益，确认投资收益时，借记“应收股利”或“应收利息”科目，贷记“投资收益”科目。对于资产负债表日发生的短期投资的公允价值的变动，小企业会计准则下不做任何处理。
企业会计准则规定，在确认应收股利或利息时，应按照应收金额直接计入交易性金融资产成本，即借记“交易性金融资产——成本”科目，贷记“投资收益”科目；同时设置“交易性金融资产——公允价值变动损益”科目，核算持有的短期投资的公允价值的变动，根据公允价值的变动额，借记或贷记“交易性金融资产——公允价值变动损益”科目，对应的损益类科目为“公允价值变动损益”。
三、短期投资的处置
短期投资最终处置时，小企业会计准则下，只需按照出售短期投资金额与其成本的差额，确认投资收益，会计处理为：借记“银行存款”等科目，贷记“短期投资”科目，差额借记或贷记“投资收益”科目。
企业会计准则除了上述处理之外，还需要将持有期间累计“公允价值变动损益”转入“投资收益”科目。